Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema4fQ9Z123 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Sema4fQ9Z123 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sema4fQ9Z123 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sema4fQ9Z123 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sema4fQ9Z123 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sema4fQ9Z123 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sema4fQ9Z123 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sema4fQ9Z123 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sema4fQ9Z123 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sema4fQ9Z123 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema4fQ9Z123 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema4fQ9Z123 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema4fQ9Z123 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema4fQ9Z123 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema4fQ9Z123 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema4fQ9Z123 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema4fQ9Z123 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema4fQ9Z123 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema4fQ9Z123 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms