Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms