Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTK8

Spo11, Meiotic recombination protein SPO11, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spo11Q9WTK8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spo11Q9WTK8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms