Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam50bQ9WTJ8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam50bQ9WTJ8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam50bQ9WTJ8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam50bQ9WTJ8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam50bQ9WTJ8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam50bQ9WTJ8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam50bQ9WTJ8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam50bQ9WTJ8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam50bQ9WTJ8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam50bQ9WTJ8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms