Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trex2Q9R1A9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trex2Q9R1A9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trex2Q9R1A9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trex2Q9R1A9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trex2Q9R1A9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trex2Q9R1A9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trex2Q9R1A9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trex2Q9R1A9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trex2Q9R1A9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trex2Q9R1A9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trex2Q9R1A9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trex2Q9R1A9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trex2Q9R1A9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trex2Q9R1A9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trex2Q9R1A9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trex2Q9R1A9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trex2Q9R1A9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trex2Q9R1A9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trex2Q9R1A9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trex2Q9R1A9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trex2Q9R1A9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trex2Q9R1A9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trex2Q9R1A9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trex2Q9R1A9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trex2Q9R1A9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trex2Q9R1A9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trex2Q9R1A9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trex2Q9R1A9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trex2Q9R1A9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trex2Q9R1A9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trex2Q9R1A9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trex2Q9R1A9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trex2Q9R1A9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms