Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gpc6Q9R087 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Gpc6Q9R087 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Gpc6Q9R087 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Gpc6Q9R087 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Gpc6Q9R087 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Gpc6Q9R087 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc6Q9R087 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Gpc6Q9R087 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Gpc6Q9R087 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Gpc6Q9R087 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Gpc6Q9R087 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Gpc6Q9R087 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc6Q9R087 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc6Q9R087 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc6Q9R087 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Gpc6Q9R087 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc6Q9R087 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc6Q9R087 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc6Q9R087 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc6Q9R087 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc6Q9R087 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc6Q9R087 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc6Q9R087 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc6Q9R087 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc6Q9R087 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc6Q9R087 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc6Q9R087 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc6Q9R087 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc6Q9R087 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc6Q9R087 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc6Q9R087 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc6Q9R087 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc6Q9R087 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc6Q9R087 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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