Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nphp1Q9QY53 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nphp1Q9QY53 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nphp1Q9QY53 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nphp1Q9QY53 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nphp1Q9QY53 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nphp1Q9QY53 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nphp1Q9QY53 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nphp1Q9QY53 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nphp1Q9QY53 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nphp1Q9QY53 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nphp1Q9QY53 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nphp1Q9QY53 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nphp1Q9QY53 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nphp1Q9QY53 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nphp1Q9QY53 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nphp1Q9QY53 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nphp1Q9QY53 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms