Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY24

Zbp1, Z-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbp1Q9QY24 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbp1Q9QY24 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms