Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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