Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tlr5Q9JLF7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms