Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms