Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms