Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trem3Q9JKE1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms