Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Riox1Q9JJF3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms