Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms