Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF7

Copb1, Coatomer subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb1Q9JIF7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copb1Q9JIF7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms