Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER71

Rhoj, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhojQ9ER71 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RhojQ9ER71 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms