Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hmgn3Q9DCB1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgn3Q9DCB1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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