Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a3Q9DC26 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms