Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U0

Ifrd2, Interferon-related developmental regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd2Q9D8U0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms