Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nop56Q9D6Z1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms