Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfn4Q9D6I3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfn4Q9D6I3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfn4Q9D6I3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfn4Q9D6I3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfn4Q9D6I3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfn4Q9D6I3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfn4Q9D6I3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfn4Q9D6I3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfn4Q9D6I3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfn4Q9D6I3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfn4Q9D6I3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfn4Q9D6I3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfn4Q9D6I3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfn4Q9D6I3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfn4Q9D6I3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfn4Q9D6I3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfn4Q9D6I3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfn4Q9D6I3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfn4Q9D6I3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfn4Q9D6I3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfn4Q9D6I3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfn4Q9D6I3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfn4Q9D6I3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfn4Q9D6I3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pfn4Q9D6I3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfn4Q9D6I3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms