Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

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Length 937 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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Ccdc39Q9D5Y1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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Ccdc39Q9D5Y1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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Ccdc39Q9D5Y1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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Ccdc39Q9D5Y1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc39Q9D5Y1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
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Ccdc39Q9D5Y1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc39Q9D5Y1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
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