Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U0

Lpcat2b, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat2bQ9D5U0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lpcat2bQ9D5U0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lpcat2bQ9D5U0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lpcat2bQ9D5U0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lpcat2bQ9D5U0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lpcat2bQ9D5U0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lpcat2bQ9D5U0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lpcat2bQ9D5U0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lpcat2bQ9D5U0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lpcat2bQ9D5U0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lpcat2bQ9D5U0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lpcat2bQ9D5U0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lpcat2bQ9D5U0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lpcat2bQ9D5U0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lpcat2bQ9D5U0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lpcat2bQ9D5U0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lpcat2bQ9D5U0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lpcat2bQ9D5U0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lpcat2bQ9D5U0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lpcat2bQ9D5U0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lpcat2bQ9D5U0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lpcat2bQ9D5U0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lpcat2bQ9D5U0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lpcat2bQ9D5U0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lpcat2bQ9D5U0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms