Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zcchc13Q9D548 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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