Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms