Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syf2Q9D198 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syf2Q9D198 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms