Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChtopQ9CY57 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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