Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms