Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Pfdn1Q9CWM4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Pfdn1Q9CWM4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Pfdn1Q9CWM4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Pfdn1Q9CWM4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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