Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ5

4930524J08Rik, RIKEN cDNA 4930524J08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524J08RikQ9CUJ5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930524J08RikQ9CUJ5 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms