Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms