Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms