Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp3Q9CQ10 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms