Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms