Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN9

Pccb, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccbQ99MN9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PccbQ99MN9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
PccbQ99MN9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
PccbQ99MN9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PccbQ99MN9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PccbQ99MN9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PccbQ99MN9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PccbQ99MN9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PccbQ99MN9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PccbQ99MN9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PccbQ99MN9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PccbQ99MN9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PccbQ99MN9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PccbQ99MN9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PccbQ99MN9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PccbQ99MN9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PccbQ99MN9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PccbQ99MN9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PccbQ99MN9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PccbQ99MN9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PccbQ99MN9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PccbQ99MN9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PccbQ99MN9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PccbQ99MN9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PccbQ99MN9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PccbQ99MN9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PccbQ99MN9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PccbQ99MN9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PccbQ99MN9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PccbQ99MN9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PccbQ99MN9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PccbQ99MN9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PccbQ99MN9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PccbQ99MN9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PccbQ99MN9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PccbQ99MN9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms