Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nmd3Q99L48 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms