Protein–RNA interactions for Protein: Q99JX1

Taf11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf11Q99JX1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Taf11Q99JX1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms