Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms