Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn16Q925N4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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