Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms