Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCG9

Rfxap, Regulatory factor X-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxapQ8VCG9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RfxapQ8VCG9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms