Protein–RNA interactions for Protein: Q8K558

Treml1, Trem-like transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml1Q8K558 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Treml1Q8K558 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Treml1Q8K558 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms