Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FgbQ8K0E8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FgbQ8K0E8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FgbQ8K0E8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FgbQ8K0E8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FgbQ8K0E8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FgbQ8K0E8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms