Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW4

Cpne5, Copine-5, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne5Q8JZW4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cpne5Q8JZW4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms