Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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