Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp27Q8CEG8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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Usp27Q8CEG8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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