Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R0

Usp37, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 37, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp37Q8C0R0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp37Q8C0R0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms