Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rbbp5Q8BX09 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp5Q8BX09 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms