Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLE7

Slc17a6, Vesicular glutamate transporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc17a6Q8BLE7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc17a6Q8BLE7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms